Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC8Q09428 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms