Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms