Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms