Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms