Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GBE1Q04446 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms