Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms