Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms