Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms