Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA9P57773 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA9P57773 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA9P57773 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA9P57773 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA9P57773 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA9P57773 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA9P57773 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA9P57773 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA9P57773 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA9P57773 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA9P57773 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA9P57773 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA9P57773 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA9P57773 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA9P57773 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA9P57773 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA9P57773 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA9P57773 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA9P57773 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA9P57773 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA9P57773 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA9P57773 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA9P57773 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA9P57773 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA9P57773 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA9P57773 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA9P57773 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA9P57773 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms