Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLCSP50747 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLCSP50747 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLCSP50747 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLCSP50747 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLCSP50747 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLCSP50747 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLCSP50747 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLCSP50747 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLCSP50747 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLCSP50747 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLCSP50747 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLCSP50747 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLCSP50747 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLCSP50747 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLCSP50747 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLCSP50747 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLCSP50747 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLCSP50747 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLCSP50747 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLCSP50747 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms