Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP4P49662 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP4P49662 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP4P49662 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP4P49662 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP4P49662 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP4P49662 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP4P49662 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP4P49662 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP4P49662 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP4P49662 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP4P49662 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP4P49662 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP4P49662 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP4P49662 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP4P49662 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP4P49662 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP4P49662 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP4P49662 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP4P49662 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP4P49662 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP4P49662 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP4P49662 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP4P49662 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP4P49662 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms