Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTAP49354 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNTAP49354 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTAP49354 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNTAP49354 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms