Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms