Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ETV4P43268 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETV4P43268 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV4P43268 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms