Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCKBRP32239 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms