Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms