Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCHP24723 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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