Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms