Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
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PTPRAP18433 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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PTPRAP18433 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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PTPRAP18433 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
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PTPRAP18433 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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PTPRAP18433 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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PTPRAP18433 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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PTPRAP18433 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
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PTPRAP18433 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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PTPRAP18433 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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