Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms