Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD3P0DMS9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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