Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00032P0C843 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms