Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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