Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB1P08034 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJB1P08034 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJB1P08034 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms