Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBP07199 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBP07199 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBP07199 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBP07199 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBP07199 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBP07199 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBP07199 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBP07199 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBP07199 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBP07199 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBP07199 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBP07199 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBP07199 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPBP07199 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPBP07199 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPBP07199 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPBP07199 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPBP07199 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPBP07199 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPBP07199 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPBP07199 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPBP07199 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPBP07199 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPBP07199 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPBP07199 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPBP07199 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPBP07199 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPBP07199 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPBP07199 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPBP07199 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPBP07199 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPBP07199 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPBP07199 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPBP07199 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPBP07199 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPBP07199 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPBP07199 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPBP07199 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPBP07199 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPBP07199 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPBP07199 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPBP07199 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPBP07199 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPBP07199 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPBP07199 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPBP07199 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPBP07199 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPBP07199 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPBP07199 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPBP07199 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPBP07199 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPBP07199 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPBP07199 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPBP07199 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPBP07199 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPBP07199 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBP07199 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms