Protein–RNA interactions for Protein: O95025

SEMA3D, Semaphorin-3D, humanhuman

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3DO95025 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SEMA3DO95025 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SEMA3DO95025 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SEMA3DO95025 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SEMA3DO95025 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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SEMA3DO95025 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3DO95025 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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