Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIN3BO75182 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms