Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms