Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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