Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TO15178 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TO15178 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TO15178 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TO15178 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TO15178 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TO15178 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TO15178 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TO15178 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TO15178 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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