Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QRK9 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QRK9 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QRK9 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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