Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFAP73A6NFT4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms