Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms