Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIPSLA2A3N6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms