Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YYE9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YYE9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms