Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
USP20Q9Y2K6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms