Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms