Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17■□□□□ 0.31
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