Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH7Q9ULB5 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms