Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms