Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms