Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms