Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms