Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms