Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HMG20AQ9NP66 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HMG20AQ9NP66 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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HMG20AQ9NP66 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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HMG20AQ9NP66 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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