Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms