Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms