Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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