Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PACSIN1Q9BY11 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN1Q9BY11 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms