Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms